近年随着乳腺癌发病率的快速增长和发病年龄的年轻化，妊娠期乳腺癌的发病率也呈现增多态势。度过了妊娠早期之后，化疗似乎并不明显增加致畸风险。
近年随着发病率的快速增长和发病年龄的年轻化，妊娠期的发病率也呈现增多态势。以细胞毒性药物为代表的化学治疗多限制用于妊娠早期患者，因为在胎儿器官发育时期存在高度致畸风险。然而，度过了妊娠早期之后，化疗似乎并不明显增加致畸风险。
妊娠期化疗的最常见并发症是早产、低体重儿、新生儿一过性白细胞减少症、新生儿一过性呼吸窘迫和宫内生长受限。研究显示，化疗在妊娠的第3个月(12周)之后至第9个月(36周)之前应用更为安全。因为胎儿的发育主要在妊娠12周前进行，此时应用化疗会明显增加胎儿致畸风险;若在妊娠36周或之后行化疗，则胎儿分娩时骨髓造血功能还未完全恢复，易导致新生儿和孕妇白细胞低进而发生感染。
2010年，欧洲产科医师协会就妊娠期乳腺癌化疗达成共识认为，可以在(新)辅助治疗中使用FEC、EC、FAC、AC和T方案。
研究显示，24例患儿的母亲曾在妊娠中期或晚期接受标准剂量的以氟脲嘧啶、多柔比星和环磷酰胺为基础的化疗(FAC方案)，未发现新生儿缺陷或比非妊娠期化疗产妇更多的不良事件。
美国MD.Anderson癌症中心的一项研究显示，57例妊娠中晚期患者接受FAC方案化疗，耐受良好。所有妊娠期乳腺癌患者分娩的胎儿均存活，其中3例存在先天性缺陷，包括唐氏综合征、先天性马蹄内翻足和先天性双侧输尿管反流。18例一直随访至入学年龄，仅有2例需进入特殊学校，其中1例为唐氏综合征。研究者将该人群的先天性疾病患病率与一般人群做比较，发现新生儿泌尿系先天性异常占3%~4%，而唐氏综合征、先天性马蹄内翻足的比例分别为1/700和1/1000。由此看来，化疗或与先天性畸形并无直接关联。
Ring等报道，27例妊娠期乳腺癌患者中，15例曾在妊娠中晚期接受过以蒽环类药物为基础的化疗，这些治疗与新生儿出生缺陷无关联。分娩的新生儿中1例存在宫内发育受限，2例存在呼吸系统疾病，需要短期的重症监护。
一组来自意大利欧洲肿瘤研究所的数据显示，20例患者妊娠中期接受表柔比星周疗方案(35mg/m2)，耐受较好，无Ⅲ~Ⅳ度不良反应;分娩的新生儿除1例存在多囊肾外，无其他先天性疾病。与FAC方案不同，表柔比星周疗方案并非乳腺癌的标准辅助治疗，而研究者认为其可降低血浆药物峰浓度，从而降低母体骨髓抑制作用和药物进入胎盘的可能。
在标准方案的乳腺癌治疗中，单药化疗是多药联合方案的一部分。理论上环磷酰胺宫内暴露存在致胎儿远期效应，因此专家组认为多柔比星或表柔比星单药可作为治疗的一部分。
甲氨蝶呤对胎儿有潜在毒性反应，因此CMF方案即环磷酰胺+甲氨蝶呤+氟脲嘧啶不推荐用于妊娠期乳腺癌患者。化疗不能用于妊娠的头3个月，对于妊娠期头3个月的乳腺癌患者，指南建议医生和患者需要考虑停止妊娠，而放疗在整个妊娠期间是不应施行的。
