上海市肺科医院（上海市肺科医院互联网医院、上海市职业病防治院、同济大学附属上海市肺科医院、上海市红十字肺科医院）创建于1933年，首任院长为国立上海医学院院长颜福庆教授。目前是一家集医疗、教学与科研功能为一体的现代化三级甲等专科教学医院，主要诊疗特色为肺癌综合治疗、疑难肺部疾病诊治、结核病防治、职业病防控及其他相关疾病的诊断和治疗。医院连续获得“上海市文明单位”，2015年以来获得全国和上海市“厂务公开民主管理示范单位”、国家卫健委“改善医疗服务示范医院”、全国平安医院工作表现突出集体、“上海市五一劳动奖状”等荣誉，行风政风测评成绩全市前茅，连年跻身复旦医院管理研究所全国医院排行榜与中国医院科技量值排行榜双百强，2020年位列复旦榜41位和科技量值榜60位。
医院主院区位于杨浦区政民路507号，占地面积10.1万平方米，建筑面积12.6万平方米，另在延庆路130号和沽源路229号设有分院区2个。作为“上海市花园单位”“杨浦区文物保护单位”，已有一个多世纪历史的“叶家花园”绿树成荫，为患者的治疗和休养提供了优美、舒适的环境。
医院核定床位1200张，设有胸外科、肿瘤科、呼吸与危重症医学科、结核科、职业病科等11个临床科室、11个医技科室和多个研究机构。现拥有胸外科、呼吸科（呼吸与危重症医学科、肿瘤科、结核科）、职业病科3个国家临床重点专科、3个上海市临床重点专科（胸外科、呼吸与危重症医学科、结核科）、2个上海市“重中之重”临床重点学科、1个上海市重点学科、2个上海市公共卫生重点学科以及上海市重点实验室、上海肺移植工程技术研究中心、上海市感染性疾病临床医学研究中心、省域重点疾病诊疗能力建设项目、上海市协同创新集群项目（恶性肿瘤免疫治疗研究）。同时，医院设立临床转化中心以及肺癌、疑难肺部疾病、结核病、职业病4个临床研究中心。在2020年复旦医院管理研究所全国专科排名中，胸外科、结核科均位列全国第2位，呼吸科获全国提名；在2020年中国医院科技量值排名中，结核病学位列全国第2位，胸外科学位列第3位，呼吸病学位列第4位。
2021年，医院提供门急诊服务1539670人次，出院117999人次，平均住院日3.58天，2021年实施胸外科手术21165例。
全院现有职工1791人，专业技术人员占93.8％，高级职称比例11.6%,研究生比例29.7%。拥有一支包含长江学者、青年长江、国家百千万人才工程人选、杰青、优青、973首席青年科学家、上海青年科技杰出贡献、上海领军人才在内的优秀人才队伍。
医院学术氛围浓厚，科技创新硕果累累。“十三五”期间，医院主持及参与国家级项目119项，牵头十三五重大专项1项、子课题2项，牵头国家重点研发计划2项，主持国家自然科学基金113项，包含杰出青年基金1项、重点项目3项、重大研究计划集成项目1项、重大研究计划培育项目2项、优秀青年基金4项，参与科技部重点研发计划2项。共立项临床研究项目319项，其中注册类临床试验项目158项，含牵头项目58项；研究者发起的临床研究161项，含国家级项目1项、省部级项目24项。发表SCI论文共666篇，含《Nature》正刊2篇、子刊4篇和《CELL》正刊1篇，单篇最高IF42.778，IF≥10分共39篇。科技奖项获重大突破，首次获得国家科技进步二等奖和上海市科技进步一等奖（肿瘤科团队项目《肺癌精准诊疗关键技术研究与推广应用》）；另获得中华医学科技奖二等奖、中华医学科技奖卫生管理奖、华夏医学科技奖三等奖、上海医学科技奖成果推广奖等成果奖励共16项。2021年是“十四五”开局之年，医院获国家自然科学基金28项，含基础科研中心1项、杰青1项、优青1项、专项项目1项。立项药物临床试验66项，其中国际多中心牵头5项，国内多中心牵头19项，合计金额6015.87万元；研究者发起的临床研究66项，其中国内多中心牵头14项，合计金额2216.18万元；共牵头及参与撰写临床研究共识或指南7项。发表SCI论文191篇，IF10分18篇。荣获上海市科技进步奖一等奖、上海市科学技术普及奖二等奖等科技奖项。
面向未来，全院职工将始终坚持以“精医重道、务实创新”的肺科精神，紧紧围绕国家和上海市卫生健康政策和公立医院办医要求，坚守公益办院初心，提升改革发展动力，秉持高质量发展理念，努力将上海市肺科医院建成专科优势明显、具有国内引领地位和较高国际影响力的区域性呼吸系统临床医疗、创新研发和人才培育中心。
